Development and characterization of SSR markers for Trichloris crinita using sequence data from related grass species
Trichloris crinita es una importante gramínea forrajera, nativa de regiones áridas del continente americano. A pesar de su importancia, no existen herramientas moleculares ni secuencias nucleotídicas disponibles para esta especie. En este estudio, se desarrollaron marcadores moleculares SSR (“sim...
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| Publicado en: | Revista de la Facultad de Ciencias Agrarias |
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| Autores principales: | , , , |
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| Acceso en línea: | https://bdigital.uncu.edu.ar/fichas.php?idobjeto=10692 |
| Sumario: | Trichloris crinita es una importante gramínea forrajera, nativa de regiones áridas del
continente americano. A pesar de su importancia, no existen herramientas moleculares ni
secuencias nucleotídicas disponibles para esta especie. En este estudio, se desarrollaron
marcadores moleculares SSR (“simple sequence repeats”) a partir de secuencias nucleotídicas
de especies filogenéticamente cercanas a Trichloris (Eleusine coracana, Cynodon
dactylon y ‘Cynodon dactylon x Cynodon transvaalensis’) y se evaluó su transferibilidad
en ocho accesiones de T. crinita y cinco especies de gramíneas cercanamente emparentadas.
De los 105 pares de cebadores evaluados, 16 amplificaron productos del tamaño
esperado en T. crinita, mientras que la transferibilidad a otras especies varió entre 12
(en Chloris castilloniana) y 28 SSRs (en Eleusine coracana). De los 16 SSRs transferibles
a T. crinita, seis fueron polimórficos y se utilizaron para analizar el grado de diversidad
genética en ocho accesiones de esta especie. El análisis reveló 23 alelos, los cuales permitieron
diferenciar todas las accesiones de T. crinita, con valores de similitud genética
entre pares de accesiones de 0,35 a 0,81 (Jaccard). Se obtuvieron valores medios de
heterocigosidad observada y esperada de 0,53 y 0,63 respectivamente. |
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